全自动核酸质谱系统检测系统NucMass2000能够实现无杂交错配干扰的检测，无需荧光染料，直接以核酸片段的分子量大小为标记，适用于各种类型的核酸分析实验。它为生物医学、临床分子诊断、转化医学、肿瘤学、个体化医疗、微生物流行病学研究等多个核酸检测领域带来了新的机遇。

质谱分析作为定量检测分，在检测的灵敏度、特异性、分析速度、多指标同时检测等方面都有非常强的优势，临床上可实现对部分传统检测方法的技术替代。技术原理是根据所选择的多态性位点设计多重PCR特异性扩增引物和延伸引物，PCR反应扩增包含多态性位点的基因序列，特异延伸引物SNP位点上延伸一个碱基，样本经过特定处理后与芯片基质共结晶。

质谱技术的基本原理是通过样品离子化，产生不同质荷比的离子，然后再经过质量分析器测定该样品中不同种类离子的分子量，并按照从小到大的顺序依次排列，得到一幅质量图谱，通过比较AGTC的信号强度及信号质量差异可得出待测样品的序列信息。

产品特点包括：1、高通量、高灵敏度、高准确率检测；2、高分辨率；3、高质量精度。应用领域包括SNP基因分型检测、遗传病检测（单基因突变）、CNV基因拷贝数变异分析、DNA甲基化检测、耐药基因检测、病原微生物检测等。

应用案例有高血压用药指导以及多呼吸道病毒、多亚型同时检测病原体分子分型。这些案例展示了该系统在个体化用药、耐药及新药筛选等临床项目中的效果，以及对微生物、病毒以及其他单倍体生物的便捷高效的分子分型、物种鉴定、变异物种发现及归类等全面分析的应用前景。