2010年8月23日，受国家发改委委托，中国国际工程咨询公司（以下简称“中咨公司”）在北京永兴花园饭店组织召开了国家蛋白质科学基础设施―北京基地(凤凰工程）建设项目可行性研究报告（以下简称“可研报告”）评估会。总后卫生部、国家教育部、中国科学院、北京市发改委和昌平区发改委的有关领导出席了会议。中心主任、军事医学科学院院长贺福初院士、院科技部徐天昊副部长、院务部任华林副部长、二所杨晓明所长、清华大学陈吉宁常务副校长、生命科学学院院长施一公教授、北京大学林建华常务副校长、生命科学学院院长饶毅教授、中科院生物物理所许瑞明副所长等出席了此次会议。
专家组认真听取了军事医学科学院、清华大学、北京大学、中科院生物物理所等建设单位和可研报告编制单位中国中元国际工程公司的汇报，并与出席会议的建设单位的领导和专家进行了充分的交流。专家组认为，凤凰工程是在国家层面统一部署、集中建设的大型基础设施，是开展大规模蛋白质研究与开发，抢占生命科学研究战略前沿必要的基础条件，其建设符合《国家中长期科学和技术发展规划纲要（2006―2020年）》总体部署要求。
根据前期对该项目情况的了解以及可研报告中各项建设条件的充分论证分析，专家组认为，该项目建设单位拥有科研基础雄厚、专业水平顶尖的人才队伍，为项目建设提供了雄厚的技术支持和保障；项目技术方案合理，选址及建设规模符合北京市规划要求，布局合理；项目所在位置的市政条件配套完善，环境保护措施和节能措施完备，投资估算全面细致，规范合理。
经充分讨论，专家组一致认为，该项目的建设将进一步提升我国蛋白质科学的整体研究水平和能力，培养高水平人才，为我国生命科学研究和发展做出重要贡献；该项目建设条件已经基本具备，可行性研究分析合理，应加快项目前期工作，尽早获得国家批复并开工建设。同时专家组建议进一步健全对外开放的运行机制，促进科研院所与高等院校之间的强强联合和资源集成，使该设施充分发挥作用。
会上，总后卫生部、国家教育部和中国科学院有关领导希望项目建设单位继续团结协作，利用这个契机，建设和完善我国蛋白质科学的支撑体系，共同为我国我军的蛋白质科学乃至生命科学的发展做出更大的贡献，同时也为今后生命科学领域的其它大型设施的建设起到引领和示范作用。
最后，贺福初院士对国家发改委、中咨公司、国家教育部、总后卫生部、北京市发改委等相关部门和评审组专家长期以来对该项目的关心和支持表示感谢。作为项目法人单位的负责人、项目建设总负责人和首席科学家，贺院士同时表示，要充分发挥解放军敢打硬仗、能打胜仗、会打漂亮仗的传统，联合清华大学等优势单位，把“凤凰工程”建设好，管理好、运行好，让这只“凤凰”飞起来。这个项目之所以命名为“凤凰工程”，就是希望这个国家设施能充分发挥国家级公共平台的作用，有力支撑我国乃至全世界的蛋白质科学的发展和腾飞。
清华大学生命科学学院王志新院士、隋森芳院士、科研院王治强副主任，北京大学生命科学学院科研部周辉部长，我院科技部综合计划处徐池副处长、二所科技处王东根处长、甄蓓副处长等领导出席了此次会议。
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