全新一代Orbitrap Exploris120在代谢流中的应用

应用领域:生命科学,多组学/蛋白质组/代谢组/脂质组

检测样品:13C6标记的葡萄糖培养的肿瘤细胞,取经淬灭 后收集的细胞

检测项目:全新一代Orbitrap Exploris120在代谢流中的应用

参考标准:赛默飞世尔科技

方案摘要 方案摘要

正常细胞的生命活动由功能基因、蛋白质、以及小分子代谢物来共 同承担,代谢物处于基因调控网络的最下游,在维持机体的正常生 理功能过程发挥着重要的作用。近年来,随着技术的发展,代谢组 学已逐渐显现出在疾病生理病理相关过程、生物标志物、机制探索 以及新的治疗靶点研究中得到广泛的应用,成为生命科学领域研究 不可或缺的技术手段之一。 然而,机体的代谢网络往往高度复杂且动态变化的。因此,我们无 法以代谢物的含量高低来反应细胞内的代谢率和代谢途径的活性信 息。例如,代谢物积累可能来源于上游物质产量的增加,也也可能 来自于下游物质消耗量的减少。同时应注意的是,生物体内的代谢 物来源可能存在多条路径,因此代谢物丰度的变化也可能来源于已 知或未知的代谢通路。因此,单纯从代谢物丰度变化的显著程度来 解释疾病发生发展的过程,存在很大的不确定性[1]代谢流量分析通过使用稳定同位素示踪剂进行生物体实验,检测生 物样本中的代谢物水平以及稳定同位素标记的状态,从而推断代谢 物流经的通路及流量,提供相关代谢物在某一通路的动态变化信息 [2-4]。这项技术已成为近年来的研究热点技术之一,在肿瘤、糖尿病 等疾病机制研究中得到广泛的应用。 本文拟通过肿瘤细胞样品,建立基于Orbitrap Exploris 120超高分辨 质谱的代谢流分析方法,并通过Compound Discoverer 软件对代谢 流数据进行处理,以验证Exploris 120及数据处理平台在代谢流分 析中的应用潜力和特点,以期能为开展代谢流研究的科研人员提供 帮助。

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