高清晰数据直接分析:应用四极杆离子淌度飞行时间质谱进行非靶向蛋白质组学分析

应用领域:

资料类型:

方案摘要

 

Keith Richardson1 , Christopher J. Hughes1 , Arkadiusz Grzyb1 , Dominic Helm2 , Bernhard Kuster2 , Jason Wildgoose1  

1沃特世公司 (英国曼彻斯特) 

2慕尼黑理工大学 (德国弗赖辛)

应用优势

  ■ 改善蛋白质识别,增加蛋白质组覆盖范围

  ■ 即使在极低浓度下也能实现可靠鉴定

  ■ 更有效地进行LC/MS/MS分析从而加快决策过程

简介

随着自下而上(bottom-up)蛋白质组学分析的复杂性不断增加,对于质谱仪的能力提出了挑战,其需要生成更多的详细信息才能满足用户的需要。近年来,质谱仪的速度、灵敏度和质量数准确性都有了显著的提高,可获得更好的数据质量、改善的肽序列标注以及更准确的鉴定结果。

随着硬件性能的改善,我们开发出一系列新型LC/MS采集方案和碎裂机制,包括母离子发现(PID)方法、非信息依赖型采集(DIA)、离子淌度(IM)辅助方法以及电子转移解离(ETD)。目前,IM主要应用于多种类型分析物的截面分析和结构分析1,可增强DIA采集的特异性,例如HDMSE。2

本研究中展示了一种新型的高清晰数据采集 (HD-DDA)模式在蛋白质和肽鉴定中的应用优势,该模式将离子淌度法结合到四极杆飞行时间质谱仪中。HD-DDA采用一种高工作周期模式,有利于决策的制定,可实现高灵敏度和选择性的实验。

 

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