一般水体和废水以及污水处理中常见的微生物有：细菌Bacteria，真菌 Fungi，藻类 Aglae，原生动物 Protozoa，轮虫 Rotifers, 甲壳纲动物Crustaceans，虫类 Worms (线虫Nematodes与扁虫Flatworms)。主要检测细菌总数、酵母菌总数、霉菌总数、大肠杆菌总数等。

　　迅数全自动菌落计数仪具有着不同类型平皿的精确统计功能，能够保存平皿图像和数据库，方面查看验证，迅数菌落分析仪器采用了菌落放大图象拍摄，高分辨率的1000万像素CCD数字成像技术和Colonfast菌落智能识别技术。