analytica China 2018 剧透 :二代测序样本质控新发展

2018-10-18 09:59

1539827795943283.jpg

在过去的数年间,二代测序( NGS )在几乎所有的遗传研究和诊断领域都发展为了一个强大的工具。而任何 NGS 实验成功的关键是初始 RNA 和 DNA 样本以及它们所生成的文库的质量控制(QC)。

理想的 NGS 质 控步骤应易于操作、经济,并且对于浓度非常低的样品也能提供快速且无争议的结果。最传统的样本质控方法是运用琼脂糖电泳法来判断样本的大小与完整性,该方 法成本低,但有种种局限性,具体就不在此赘述。确保样品“满足目标用途”的另一种方法是应用自动化的电泳分离,并进行荧光检测和自动数据分析。

安捷伦在自动化样本质控领域始终处于领先地位,并塑造了多个行业传奇:

  • 安捷伦 2100 生物分析仪于 1999 年首次问世,是迄今为止全世界使用最广泛的核酸质控平台,拥有最大的装机量;

  • 安捷伦推出的 RNA 质量标准 RIN 值( RNA 完整值)至今仍被奉为 RNA 质控的金标准;

  • 2014 年,安捷伦推出 DIN 值( DNA 完整值),为评估基因组 DNA 的完整性建立了标准;

  • 2015 年,安捷伦又推出了高通量全自动的 4200 TapeStation 系统,满足快速发展的二代测序行业对高通量核酸质量控制的需求;

1539827814115140.jpg

安捷伦 2100 生物分析仪(左),4200 TapeStation 系统(右)

近几年来,越来越多的目光正聚集于癌症的液体活检和产前无创检测,即从血液样本或其他体液中提取游离 DNA( cfDNA ),检测其中可能存在的源自癌细胞的 DNA 片段或源自胎儿的 DNA 片段。这一检测在癌症研究和产前检测中变得越来越重要。由于 cfDNA 的低含量以及高度的片段化,其样本的文库构建一直是个难点,而准确地定量 cfDNA 样品对于确定测序前 cDNA 文库制备时恰当的 DNA 用量是必不可少的。再者,由于样品处理或提取方法的不同,cfDNA 样品中可能含有较大的 DNA 片段,例如基因组 DNA 污染,这些高分子量的物质会对文库的制备产生负面影响,从而导致测序的深度较低。因此准确确定样本的纯度与片段大小分布是 cfDNA 样本质控的又一关键点。

然而,随着二代测序产业的不断发展,全球二代测序逐渐呈现从集中化大规模实验室向中小独立实验室发展的趋势。为了满足此类实验室的质控需求,安捷伦即将在今年年底推出针对中低通量的全自动核酸质控系统—— 4150 TapeStation,该系统将在今年上海的慕尼黑分析测试展首发。

1539827822531610.jpg

4150 TapeStation 系统

同时,慕尼黑展会期间,安捷伦还将参加 LSAC 生命科技论坛并作论坛报告。此次论坛将围绕“高通量测序技术与应用”的主题,从政策方向、新技术、投融资趋势等多角度展开深入探讨。在本次报告中,安捷伦德国生物分子分析事业部的产品专家将展示应用安捷伦质控平台对不同 cfDNA 样品进行质量控制的案例,并讨论其数据。

欢迎大家莅临生命科技论坛聆听安捷伦报告,并亲临安捷伦展位,实地了解安捷伦最新发布的全自动核酸质控系统。

详细信息

640?wx_fmt=png&wxfrom=5&wx_lazy=1&wx_co=1

2018 年 11 月 1 日

640?wx_fmt=png&wxfrom=5&wx_lazy=1&wx_co=1 上海新国际博览中心 E1 馆二楼,M16 会议室

主讲人信息

1539827833655079.jpg


领域:蛋白/抗体/蛋白质组,基因/基因组/测序,临床免疫学

标签:安捷伦 基因 测序 癌症 DNA