年货上线 | GC-MS靶向代谢组学定量方法及方法学验证

2020-4-19 01:44

前言

临近年底,鹿明生物给您送“年货”了,这次带来的年货是基于GC-MS靶向代谢组学定量方法及方法学验证干货。

GC-MS(气质联用)相关介绍

首先,让我们来了解下GC-MS的相关介绍~

GC-MS分离检测的原理:利用待分离的各种物质在两相中的分配系数、吸附能力等理化性质的不同来进行分离,然后进入质谱检测器进行检测的过程。

GC-MS仪器分为三个系统:进样系统;分离系统;检测系统。

GC-MS的适用范围:主要取决于化合物的性能,一般适用于分子量小、易挥发的代谢物,详情如下图:

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GC-MS靶向定量方法流程

接下来,我们通过如下图片来看一下GC-MS靶向定量方法基本流程:

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那我们再来了解靶向定量方法流程重点介绍;首先,我们来看看代谢物提取的一些注意事项:

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除了代谢物的提取,代谢物的纯化与富集也是非常重要的;那么纯化和富集的目的是什么呢?纯化主要是为了去除蛋白质、核酸、盐或者干扰目标代谢物检测的其他代谢物;富集的目的主要是提高待测物质的灵敏度和检测限。具体步骤我们也通过下面的图片了解一下:

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再来看下建GC-MS方法中非常关键的一个点:衍生化

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定量方法

接下来,再看下代谢物定量方法;定量方法主要分2种:外标法和内标法,其中外标法是比较常用的定量方法。

外标法(常用):用待测组分的标准品作对照物质,将对照物质和样品中待测组分的响应信号相比较进行定量的方法,也称为标准曲线法,是一种绝对定量的方法。

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内标法:是一种间接或相对的校准方法,在分析测定样品中某组分含量时,加入一种内标物质,以校准和消除由于操作条件、仪器波动对分析结果产生的影响,可提高分析结果的准确度。

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内标物的选择:

01.理化性质与待测物相近

02.在样品中不存在且不与样品中组分发生化学反应

03.不与仪器设备(色谱柱)发生反应

04.目标物的同位素标记物是最常用的内标物质

05.外源类似物

方法学验证

方法学验证是对测定方法的评价,是建立新方法的研究内容和依据;主要给大家介绍4点:灵敏度、精密度、准确度、线性

灵敏度

灵敏度:包括检出限和定量限

01.检出限(The Limit of Detection,LOD):指检测方法在规定的实验条件下能检出分析物的最低浓度(信噪比s/n≥3);

02.定量限(The Limit of Quantitation,LOQ):指检测方法在规定的实验条件下能定量分析物的最低浓度(信噪比s/n≥10);

准确度

准确度:实际值与计量值之间的偏差,可以用加标回收率表示。

01.准确度=(测量值/真实值)×100%;

02.加标浓度(4个加标浓度水平):定量下限加标,低浓度加标,中浓度加标,高浓度加标,每一浓度5个测试样;

03.要求准确度偏差在±15%以内,定量下限在±20%内;

精密度

精密度是指同一均匀样品在相同条件,N次重复测定结果彼此符合的程度。它们越接近就越精密,常用RSD表示精密度。

精密度:考察仪器方法和稳定性和重现性,包括日内精密度和日间精密度。

线性

线性:在外标法绘制标准曲线时需要考察线性相关性。

01.线性相关系数大于0.995。

02.通常校正标样需要5-7个有效点,且准确度需要满足80%-120%。

最后,小鹿给大家总结下本篇内容:本次干货主要分享的是如何建立基于GCMS靶向代谢组学方法。有更多不同观点,欢迎留言交流讨论哦~

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PS:关于这个主题内容的分享,我们专门制作了视频资料哦,没太听懂的童鞋们欢迎加小鹿微信索要本节干货视频哦,一键掌握如何建靶向代谢组学方法哦~ 

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领域:多组学/蛋白质组/代谢组/脂质组

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