蛋白组学主要以全蛋白组（组织、细胞和器官）、线粒体蛋白组、叶绿体蛋白组和外泌体蛋白组为研究对象，通过对蛋白组进行定性、定量、分子功能分析、通路互作分析和蛋白互作分析，揭示生物学功能、作用机制、疾病诊断的标志物以及预测蛋白的上、下游变化关系。蛋白质组学可以克服核酸水平预测的不确定性、反映核酸翻译后修饰情况。01.常用技术1. 非靶向蛋白组学1.1 蛋白质定性（胶条鉴定和溶液鉴定）1.2 高通量定量蛋白组（Label free、 iTRAQ/TMT 和 DIA 定量）1.3 多肽组学2. 靶向蛋白组（PRM 靶向蛋白/肽段定量）3. 修饰蛋白组学（定量磷酸化修饰组学、定量糖基化修饰蛋白组学、定量乙酰化修饰蛋白组学和定量泛素化修饰蛋白组学）4. 互作蛋白组学（代谢物与蛋白互作研究）02.仪器平台

03.蛋白序列数据库最常用 Uniport 数据库，第二优先级是 GeneBank/NCBI 数据库，最次选择 RNA sequence 序列信息进行氨基酸转换。04.搜索软件Proteome Discovery、Mascot、SEQUST、MaxQuant05.基本流程

06.分析结果展示1. 基础分析数据预处理差异表达蛋白筛选2. 常规数据分析

主成分分析

火山图分析

层次聚类分析

3.功能分析 

COG 注释分析

亚细胞定位分析

GO 注释富集分析

KEGG 注释富集分析

PPI 网络构建分析

4.修饰蛋白特有分析

Motif 分析

激酶（kinase）预测分析

领域：细胞生物学,微生物,生理生态,分子生物学,蛋白/抗体/蛋白质组,基因/基因组/测序,多组学/蛋白质组/代谢组/脂质组,其他生命科学