Sushmit Maitra
Acceleron Pharma
生物分析开发团队
Acceleron Pharma 正在同时使用质谱技术和传统的免疫测定来开展一项药物研发项目，该项目早期阶段将为潜在的生物治疗性药物的效果提供更有力的洞见。此公司正在使用 TripleTOF™ 6600系统开发一系列基于 TGF-β 和相关蛋白的治疗性药物。
Acceleron Pharma 是一家总部位于马萨诸塞州剑桥的生物制药公司，专注于开发利用 TGF-β 蛋白超家族（一种富含目标位点、负责细胞生长和修复的生物区域）功能的全新治疗性药物。该公司从事药物开发的所有领域，从早期发现到后期的临床试验，他们生物分析开发团队的科学家 Sushmit Maitra 表示：“我们的研究重点在于影响 TGF-β 信号通路，以解决许多严重疾病和罕见病。我们的工作涵盖从最早阶段的治疗性药物靶点识别到后期临床试验的方面，我们的重点产品 luspatercept 目前已进入第三期临床试验，该产品可用于治疗慢性贫血及相关并发症骨髓增生异常综合征和 β- 地中海贫血。我的团队隶属于生物分析部门，负责药物研发流程中的一些环节，重点研究动物模型中候选生物治疗性药物的药代动力学。”
免疫测定技术是生物制药开发的基础方法，可以提供特定分析来监控潜在生物治疗性药物的效果。不过，先进质谱系统和非数据依赖型分析方案的开发预示着质谱在许多应用领域正在挑战免疫测定的地位。Sushmit 接着表示：“许多年来，免疫测定一直是研究蛋白治疗性药物的首选方法，它具有良好的特异性，灵敏度也不断提升。不过，酶联免疫吸附测定（ELISA）等技术需要开发对靶分子和样品基质具有特异性的高质量抗体来确保结果的准确性和排除干扰物。相比之下，质谱多使用通用试剂，并依靠检测系统提供所需的特异性。从试验开发角度而言，质谱具有很大优势，可以帮助您创建几乎“即插即用”的方法，这些方法经过快速且简单的调整还能用于新的靶分子。大多数质谱工作流程的缺点在于，就目前而言，分析大多数生物基质之前必需进行样品制备，耗时耗力。因此，我们的目标是同时使用免疫测定和质谱，以便从我们的体内表征研究获取更多数据。”
“鉴于我们的质谱项目才刚起步，方法开发是我们选择质谱系统时的重要考量。尽管 SCIEX Triple Quad™ 系统似乎已成为生物分析的行业标准，但在我看来，我们理想的四极杆飞行时间 (Q-TOF) 仪器需要兼具三重四极杆系统的诸多优点和有助于简化试验开发的额外灵活性。幸运的是，使用这些技术开发新试验有着非常相近的考量，大大简化了为进行常规筛查活动而在不同系统间转移试验的工作。我们之所以选择SCIEX TripleTOF™ 6600 系统，是因为这个平台既能满足高分辨率的要求，也可以执行全扫描进行定量分析。这个系统还提供 MRM-HR，这对于开发后续能够转移至三重四极杆仪器的方法显然至关重要，我们可以选择未来依靠 SWATH 采集技术实现更高级别的多重分析。
TripleTOF 系统的另一个优势在于，使用这个系统时很容易编写和保存供其他人使用的方法。这便简化了系统的日常运作，对于同时使用免疫测定和质谱技术的实验室而言更是如此，毕竟用户不需要弄懂质谱分析样品的复杂原理。MultiQuant™ 软件也具有同样的优势；您只需运行现有分析方法即可，无需成为质谱方面的专家。”
Sushmit最后表示：“目前，我们的大多数定量分析工作需要首先获得 TOF MS 的全扫描数据，只有存在与基质相关的干扰物时才使用 MRM-HR。这给我们提供了更加全面的数据，诸如哪些肽的选择性已经够了，哪些肽可以提供较好的信号等，我们基于这些数据构建 MS/MS 和 MRM 方法。尽管我们仍处在此项目的初期，但我们的目标是开发一种能提供与 ELISA 同等通量和便利的质谱工作流程。我认为质谱并不会完全取代免疫测定，毕竟具有合理设计的 ELISA 在便利性和灵敏度方面很难被超越，但质谱方法可以提供不同的信息。例如，它可以为您提供结构数据，这对于了解某种治疗性药物的体内修饰和代谢可能非常关键。我们的目标是提供一种具有不同优势的补充方法；问题不在于哪种方法更好，而在于哪一种技术才是解决您问题的最佳方案。”
“它需要兼具三重四极杆系统的诸多优点和有助于简化试验开发的额外灵活性。”
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