定量蛋白质组学(Quantitative Proteomics)是对一个基因组表达的全部蛋白质或一个复杂混合体系内所有蛋白质进行精确鉴定和定量。可用于筛选和寻找任何因素引起的样本之间的差异表达蛋白,结合生物信息学揭示细胞生理病理功能,同时也可对某些关键蛋白进行定性和定量分析。
Label-free:无标签标记的定量蛋白质组学研究,依赖于繁杂的信息分析完成定量过程,主要有两种:信号强度和谱图计数法。前者根据一级质谱相关的肽段峰强度(Mass spectral peak intensity)、峰面积(Peak area)、液相色谱保留时间(LC retention time)等信息进行定量分析;后者根据二级质谱相关的每个蛋白鉴定到的肽段总次数(Peptide hide或Spectral counts)、所鉴定肽段的离子价位(Ion counts of identified peptides)等信息进行定量分析。定量原理可见下图: