全基因组重测序(Resequencing)是对基因组序列已知物种进行不同个体间的基因组测序，并在此基础上对个体或群体水平进行差异性分析。通过全基因组重测序，可以全面的挖掘基因序列差异和结构变异，应用范围涉及群体遗传学研究、关联分析、进化分析、临床医药研究等众多领域。

随着测序成本的大幅度降低以及测序效率的数量级提升，全基因组重测序已经成为研究动植物分子育种及人类疾病zei为快速有效的方法之一。

技术路线：

结果案例：

T-DNA插入位点检测

数据分析：

1、基本数据分析：数据产出统计、参考序列比对

2、SNP检测与统计

3、InDel检测与统计

4、结构变异（SV）分析

5、  拷贝数变异（CNV）分析

参考文献：

1、Jia G, et al. A haplotype map of genomic variations and genome-wide association studies of agronomic traits in foxtail millet (Setaria italica) .Nature Genet. 2013; 45: 957-961.

2、Huajun Zheng,et al. The genome of the hydatid tapeworm Echinococcus granulosus Nature Genetics 45,1168–1175 (2013)