iTRAQ ( Isobaric tag for relative and absolute quantitation ) 采用液质联用的方法高通量地检测多组别间的蛋白质表达差异。蛋白质酶切成多肽后，用iTRAQ同位素试剂标记多肽N末端或赖氨酸侧链基团。标记后的多肽经过液相色谱分离，进行一级和二级质谱分析，在二级质谱前，被标记的不同样本中的同一多肽表现为相同的荷质比和其它理化性质；在二级质谱中，多肽被破碎后产生不同的信号离子，信号离子表现为不同荷质比（113~119,121）的峰，根据波峰的高度及面积，可以鉴定出蛋白质，并分析出同一蛋白质在不同组别中的定量信息。
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