利用激光束经照明针孔形成点光源对标本内焦平面的每一点扫描，照明针孔与探测针孔相对于物镜焦平面是共轭的，焦平面上的点同时聚焦于照明针孔和发射针孔，焦平面以外的点不会在探测针孔处成像，这样得到的共聚焦图像是标本的光学横断面。激光共聚焦扫描显微镜主要由激光光源系统、扫描检测系统、显微镜系统、计算机系统及相关软件等组成。
 
该设备应用范围：
1)对细胞、组织、活细胞进行连续扫描，获得精细的单个细胞或一群细胞的各个层面结构的图像；
2)能够对荧光标记或自发荧光微米或纳米球进行成像观察，可以观察载体内荧光标记药物的分布；
3)可以用于药物载体、药物对细胞的作用及其动力学研究，能够利用荧光标记，测定细胞内如钠、钙、镁、pH等离子浓度的比率及动态变化；
4)可以用于荧光标记或自发荧光微米或纳米药物载体的细胞吞噬行为及其在组织中的分布研究等。

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