飞行时间液质联用系统利用离子源产生的碎片来支持MS/MS分析应用。该系统配备了安捷伦的全离子MS/MS软件，可以将碎片化模式与安捷伦的MS/MS数据库匹配，以实现化合物的鉴定。典型的全离子分析应用包括毒理学分析，利用含2500种化合物的安捷伦个人化合物数据库，以及兽药分析，利用含600多种化合物的数据库。产品特性包括：质量准确度优于1ppm，可减少假阳性结果；每秒30张谱图的数据采集速度，确保在高通量工作流程中获得优异的数据质量；使用MassHunter软件中的按化学式查找功能，可靠鉴定小分子；质量分辨率优于22000，能够从干扰物中分离目标化合物；安捷伦喷射流技术可在极低浓度下检测杂质，实现柱上皮克级的灵敏度；能够在更多基质化合物存在的情况下鉴定痕量目标化合物，谱图动态范围高达5个数量级；直观的无人值守软件使6230B成为药物和合成化学家以及生物学家的理想分析工具。此外，该系统还配备了新型的全离子MS/MS技术，用于在TOF和Q-TOF液质联用系统上进行目标化合物和非目标化合物的筛查。