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甘肃兰州甘肃省药品检验研究院
Ion S5™系统提供了一套高度简化的靶向测序流程, 单次测序所需手工操作时间不到15分钟。 同时也是唯一一款同时兼容靶向测序、 小基因组、 外显子组和转录组测序的台式测序仪。 基于新一代半导体测序技术和最新的 Ion Hi-Q™化学试剂, Ion S5系统能够为用户提供更快运行速度、 简化的靶向测序流程以及高质量数据。
Ion Torrent半导体测序技术运用大规模并行半导体传感器专利技术, 直接对DNA复制过程中生成的氢离子进行实时检测。 Ion Torrent半导体芯片中高密度的微孔阵列提供了数百万个单独的反应器, 而集成的流体通路引导反应试剂流经传感器阵列。这种流体通路、 微型机械加工与半导体技术的独特组合, 能够将遗传信息(DNA)直接转换为数码信息(DNA序列), 为您的研究应用快速生成大量的高质量数据。
产品特点:
1.简捷:手工操作时间不到15分钟;
从DNA样品输入到获取分析数据*靶向测序工作流程手工操作时间不到45分钟。
2.速度:从DNA样品输入到获得分析数据*只要24小时;
每次测序运行只要2.5到4小时。
3.低样品输入量:只需要10ng的低质量的DNA 或者RNA,就能产生突变或基因表达谱。
4.可扩展:无论癌症、遗传性疾病、传染病还是生殖基因组研究——所有这一切仅需要一台测序仪。
工作流程:
系统配有Ion Chef 系统及自动的跟踪模块,加样、建库、模板制备等,总手工操作时间仅需45分钟。
产品规格:
Ion GeneStudio S5 System | Ion GeneStudio S5 Plus System | Ion GeneStudio S5 Prime System | |
可兼容芯片 | Ion 510, 520, 530, and 540 Chips | Ion 510, 520, 530, 540, and 550 Chips | |
尺寸(WxDxH) | 54.2 x 80.6 x 50.9 cm | ||
重量 | 63.5 kg | ||
电源 | 100–240 VAC, 50/60 Hz, | 100–240 VAC, 50/60 Hz, | 100–240 VAC, 50/60 Hz, |
6.5–14.5 A | 6.5–14.5 A | 6.5–14.5 A | |
仪器所需空间 | 顶部 = 30.5 cm (12.0 in.) 左侧= 10.0 cm (4.0 in.) 右侧 = 30.5 cm (12.0 in.) | ||
前端 = 30.5 cm (12.0 in.) 后端 = 30.5 cm (12.0 in.) | |||
工作环境 | • 温度:20-30°C (68-86°F) | • 温度:15-30°C (59-86°F) | • 温度:15-30°C (59-86°F) |
• 湿度:40-60%,非凝露 | • 湿度:10-80%,非凝露 | • 湿度:10-80%,非凝露 | |
• 海拔:最高2,000 m (6,500 ft) | • 海拔:最高2,500 m (8,200 ft) | • 海拔:最高2,500 m (8,200 ft) | |
• 1,200W典型功耗下的发热量: | • 1,200W典型功耗下的发热量: | • 1,200W典型功耗下的发热量: | |
4,094 BTU/hr | 4,094 BTU/hr | 4,094 BTU/hr(仪器); | |
1100 W: 3,752 BTU/hr | |||
其他连接方式 | 1 GigE以太网;2 x USB 2.0;RJ45端口 | ||
服务器储存空间 | -12 TB | -24 TB | -25 TB |
服务器尺寸(WxDxH) | NA | NA | 30.5 x 70.9 x 44.4 cm, 41.8 kg |
及重量 | |||
软件 | 通过Torrent Suite Software进行比对及变异检出;可与实验室信息管理系统兼容并默认与Ion Reporter Software(云端及本地服务器)整合 |
Ion GeneStudio S5系列参数细节:
芯片类型 | Reads数 | 读长 (输出数据量*) | Ion GeneStudio S5 System | Ion GeneStudio S5 Plus System | Ion GeneStudio S5 Prime System |
测序周期(测序运行**及分析时间) | |||||
Ion 510 Chip | 2-3 million | 200 bp (0.3-0.5 Gb) | 4.5 hr | 3 hr | 3 hr |
400 bp (0.6-1 Gb) | 10.5 hr | 5 hr | 5 hr | ||
Ion 520 Chip | 4-6 million | 200 bp (0.6-1 Gb) | 7.5 hr | 3.5 hr | 3 hr |
400 bp (1.2-2 Gb) | 12 hr | 5.5 hr | 5.5 hr | ||
3-4 million | 600 bp (0.5-1.5 Gb) | 12 hr | 5.5 hr | 5.5 hr | |
Ion 530 Chip | 15-20 million | 200 bp (3-4 Gb) | 10.5 hr | 5 hr | 4 hr |
400 bp (6-8 Gb) | 21.5 hr | 8 hr | 6.5 hr | ||
9-12 million | 600 bp (1.5-4.5 Gb) | 21 hr | 8 hr | 7 hr | |
Ion 540 Chip | 60-80 million | 200 bp (10-15 Gb) | 19 hr | 10 hr | 6.5 hr |
200 bp (20-30 Gb) 2 runs in 1 day | NA | 20 hr | 10 hr+ | ||
Ion 550 Chip | 100-130 million | 200 bp (20-25 Gb) | NA | 11.5 hr | 8.5 hr |
200 bp (40-50 Gb) 2 runs in 1 day | NA | NA | 12 hr+ |
*预估>99%可比对或准确测量的数据输出量。数据输出量取决于读长以及相应的应用。 |
**测序运行时间大概在2.5到4小时之间。 |
†第一轮运行的数据分析与第二轮测序的运行同时进行。 |
设备应用:
Ion S5 S5XL系统可用于的研究领域有:癌症、遗传病、非整倍体筛查、感染性疾病等。
遗传疾病研究:
通过一台测序仪扩大或缩小您的关联变异搜索范围。无论您是需要在周一测序疾病专用研究 Panel还是希望在周三测序整个基因组,Ion S5™ 和 Ion S5™ XL 系统均能为您提供所需的灵活性——而且价格也在您能承受的范围内。
癌症研究:
采用完整、综合和易用的工作流程检测生殖细胞和肿瘤 DNA 中的低频肿瘤相关变异,现已可通过 Ion S5 和 Ion S5 XL 新一代测序系统实现。除了易用的工作流程外,Ion AmpliSeq 技术更有从低至 1 ng 的 FFPE DNA 或 RNA 构建文库的可靠性能。
液体活检研究:
在揭秘液体活检样本的游离 DNA (cfDNA) 和游离肿瘤细胞 (CTCs) 的潜在作用方面,新分子方法的开发已经取得了巨大的进步。
相关的综合解决方案提供了疗法管理和复发的潜在方法,有可能克服目前的肿瘤组织样本获取方法存在的很多局限。
Ion S5 系统和 Ion Chef™ 系统结合,再辅以我们的 Oncomine 检测试剂盒及强大生物信息学软件的靶向内容,让您可以通过一个简单的综合工作流程,更好地理解并追踪原发性肿瘤驱动因子和肿瘤异质性。
传染病研究:
新一代测序 (NGS) 已经变革了微生物和遗传疾病研究。
Ion S5 和 Ion S5 XL 系统使您可以从分离物进行全细菌基因组测序,或在无需培养的情况下,直接对来自生物学样本的特定病毒、细菌或真菌基因(例如,16S 基因或抗生素耐受性基因)测序。此外,由于半导体测序具有较高的速度,您可以在短短 24 小时内获得测序结果。了解如何通过 NGS 法,轻松、快速地开始对传染性微生物进行测序。