miRNA测序分析

microRNA是一类内生的、约有22个核苷酸组成的非编码小分，其在细胞内具有多种重要的调节作用。一个miRNA可以有多个靶基因，而几个miRNA也可以调节同一个基因。这种复杂的调节网络既可以通过一个miRNA来调控多个基因的表达，也可以通过几个miRNA的组合来精细调控某个基因的表达。研究表明，microRNA可作为一些已知疾病诊断的生物标记，并参与机体各种生理活动，如细胞生长凋亡、心脏发育、胚胎后期发育等。

miRNA主要研究策略：

1、探究某miRNA与肿瘤的增殖相关的具体调控机制；

2、寻找在抑制或促进肿瘤细胞凋亡方面发挥作用的miRNA；

3、探究肿瘤的血管形成、肿瘤的转移等肿瘤微环境相关的发生机制;

4、探究某种疾病的能量代谢、免疫等相关机制；

5、寻找与肿瘤基因组不稳定性的相关性等；

主要分析内容：

1、数据产出统计和质量评估；

2、reads与参考序列比对；

3、表达丰度统计；

4、表达水平分析；

5、差异表达基因筛选；

6、miRNA靶基因预测；

7、miRNA靶基因GO富集分析；

8、miRNA靶基因KEGG Pathway富集分析。

技术参数:

1、 样本类型：血清、血浆、细胞培养上清、组织等。

2、推荐数据量：10M clean reads

3、 测序策略：HiSeq SE50