为了评价候选代谢物的合理性，同时更全面直观地显示样本之间的关系以及代谢物在不同样本中的表达模式差异，我们利用定性的显著性差异代谢物的表达量对各组样本进行层次聚类（Hierarchical Clustering），从而辅助我们准确地筛选标志代谢物，并对相关代谢过程的改变进行研究。一般来说，当筛选的候选代谢物合理且准确时，同组样本能够通过聚类出现在同一簇（ Cluster）中。同时，聚在同一簇内的代谢物具有相似的表达模式，可能在代谢过程中处于较为接近的反应步骤中。下图显示了显著性差异代谢物层次聚类结果。

图 1显著性差异代谢物层次聚类结果