基于LC-MS/MS分析能够精确测定蛋白质或多肽分子质量这一特性,从而检测蛋白质或者多肽上位点发生何种修饰。可检测修饰类型如下: 磷酸化、糖基化、乙酰化、泛素化、丙酰化、丁酰化、丙二酰化、戊二酰化、琥珀酰化、单甲基化、二甲基化、三甲基化
先通过IP得到目的蛋白,再通过SDS-PAGE对目的蛋白进行分离纯化,将胶条上目的蛋白对应的条带切下进行胶内酶解和高灵敏度的液质联用分析(LC-MS/MS),通过数据库检索得到蛋白上的修饰位点。
可一次性扫描三种常规修饰类型;
分析不局限于常规PTM,可根据确定的氨基酸位点和修饰类型进行个性化靶向修饰分析。
磷酸化:信号转导、细胞周期、生长发育及癌症机理等;
糖基化:蛋白质折叠、更新以及免疫应答等;
乙酰化:基因表达调控、细胞凋亡、细胞代谢、蛋白质稳定性以及神经退行性病变等;
泛素化:细胞周期、细胞凋亡、转录调控、DNA修复以及信号转导等;
甲基化:染色质结构及转录调控等;
丙酰化 / 丙二酰化 / 戊二酰化 / 琥珀酰化:主要存在于线粒体和细菌中,与代谢过程密切相关。
双向凝胶胶点:考染、银染(质谱兼容)点清晰可见;
SDS-PAGE条带:考染、银染(质谱兼容)点清晰可见
蛋白质溶液:蛋白总量>5ug,浓度>0.1ug/ul,缓冲液不含去污剂SDS、NP40,Triton X-100等
[1]. Tamura K, Fukao Y, et al. Identification and characterization of nuclear pore complex components in Arabidopsis thaliana. Plant Cell.2010; 22(12) 4084-97.
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