比较转录组，是结合RNA-seq技术手段研究物种进化的技术手段。通过不同物种或亚种间mRNA序列差异分析近源物种间的亲缘关系，挖掘明显受到正向选择或负向选择的基因。是一种快速、全面解析不同品系、不同亚种进化关系及特定组织表达情况的生物学方法，能够从序列水平和基因表达水平发掘物种进化历程。适用于同一物种不同遗传背景品系（不同亚种、野生种、栽培种）的进化研究。已广泛应用于水稻、拟南芥、番茄等物种研究中。

送样要求

• RNA总量：≥2ug

• RNA浓度：≥100 ng/ul

• RIN值：≥7.0

技术特色

• 丰富的项目经验，全方位高效挖掘直系同源基因；

• 1对1项目服务，直接对接生信分析师，没有中间环节，沟通更高效；

• 多种个性化分析方案，全方位满足研究需要，助力科研成功。

GO多级分类注释分布饼图

KEGG注释统计

直系同源基因进化树

直系同源基因Ka/Ks分布图

Divergent和conserved 直系同源基因KEGG 注释通路图

SSR分布情况

1. Comparative transcriptome analysis reveals potential fruiting body formation mechanisms in Morchella importuna. AMB Express (IF=2.226), 2019.

2. Investigation of yellow horn (Xanthoceras sorbifolia Bunge) transcriptome in response to different abiotic stresses: a comparative RNA-Seq study. RSC Advances (IF=3.049),2020.