全长转录组，是基于三代测序平台，无需打断拼接，直接获得包含5’，3’UTR，polyA尾的完整转录本，从而准确分析有参考基因组物种可变剪接及融合基因等结构信息，克服无参考基因组物种转录本拼接较短、信息不完整的难题。同时还可以借助二代测序数据，进行转录本特异性表达分析，获得更加全面的注释信息。

Sequel 测序原理

全长有参转录组：对于有参考基因组的物种，利用三代全长转录组测序获得的信息是生物体内直接存在的，比基于参考基因组预测到的转录组信息更准确，同时也可准确鉴定基因的可变剪接、融合基因、基因家族和非编码RNA等信息。同时基于全长转录组数据，可以优化基因结构，进而辅助基因组组装和注释。

全长无参转录组：由于基因组测序成本高，缺乏基因组参考信息在很大程度上限制了对物种的深入研究。通过三代全长转录组测序来构建物种Unigene库，无需进行序列组装，就可以获得该物种转录组水平的全长转录本信息，更准确的进行CDS和SSR分析，为后续研究提供良好的遗传信息基础。

全长无参转录组

技术优势

• 无需进行转录本的拼接便可以直接获得全长转录本序列，能够更真实地反映测序物种的转录组信息；

• 通过检测多种可变剪接形式,可发现更多的剪接位点和可变剪接事件；

• 能够发现新的功能基因，补充基因组注释；

• 有助于融合基因、同源基因、超家族基因或等位基因的精确分析。

送样标准

• 样品类型：总RNA、组织样；

• 样品浓度：总RNA浓度≥ 50 ng/ul；

• 样品体积：> 10 ul；

• 样品总量：总RNA用量> 10 ug ；

• 样品纯度：OD260/280≥1.8，OD260/230≥1.0，260nm处有正常峰值；

• RNA完整性：总RNA的RIN值≥8.0；图谱基线无上抬；5S峰正常。

分析示例

GO分类统计图

COG统计图

KEGG注释统计

转录因子分析

lncRNA编码潜能预测图

差异基因可视化散点图与火山图

上下调差异基因GO注释柱形图

SSR的分布情况