RNA免疫共沉淀(RIP, RNA Immunoprecipitation)是研究细胞内RNA与蛋白结合情况的技术,是了解转录后调控网络动态过程的有力工具,能帮助我们发现miRNA的调节靶点。这种技术运用针对目标蛋白的抗体把相应的RNA-蛋白复合物沉淀下来,然后经过分离纯化就可以对结合在复合物上的RNA进行测序分析,是研究细胞内RNA与蛋白结合情况的技术。
技术流程
技术优势
用于在全基因组范围内研究蛋白特异结合的RNA片段
组蛋白修饰和表观遗传修饰的技术,研究这三个主题有助于洞悉蛋白
对基因表达的调控以及染色体的功能结构
具有“覆盖全,周期快,分析科学”的优势
已广泛应用于人、小鼠、酵母、水稻、拟南芥等物种的研究
送样要求
RNA总量≥50ng,浓度≥10ng/μl,无降解,无粘稠/颜色异常,无DNA/蛋白质污染;
使用RNaseFree的离心管,标记清晰,样品-80℃保存,干冰寄送。
分析示例
基因组测序深度累积分布图
基因及上下游测序深度分布图
peak长度分布图
peak基因功能元件分布图
peak相关基因的GO/KEGG富集分析