靶向代谢组学分析主要是以标准品为参照,对特定的代谢物群进行有针对性地、特异性地检测与分析。
靶向代谢组学分析成功的关键因素是准确度、高通量和可靠性。虽然这类分析比代谢谱分析更为常规,但须面对非常大量(成千上万)的样品。
靶向代谢组学可以应用于:
验证由发现代谢组学实验提出的假说;
进行基于假说的探索性实验(通常根据最新的解释),针对特定代谢物,研究代谢模型。
目标代谢物绝对定量
产品定义
靶向代谢组学分析主要是以标准品为参照,对特定的代谢物群进行有针对性地、特异性地检测与分析。通常采用的技术方案包括常规的液质联用(LC-MS)分析技术,以及选择性反应/多反应监测技术(MRM/ SRM)。
技术原理
常规分析法首先利用LC-MS的方法对待分析样本进行大规模代谢组分析,然后通过与相同分析条件下标准品的分析结果进行比对,实现对样本内目标代谢群的定性和定量分析。
MRM/SRM技术是更为特异、灵敏的靶向分析方法。其主要基于已知或假定的反应离子信息,有针对性地选择数据进行质谱信号采集,对符合规则的离子对进行信号记录,去除不符合规则离子信号的干扰。定量过程中,该技术首先筛选到目标代谢物特异性的母离子,然后选择性地对这些母离子进行碰撞诱导,去除其他离子的干扰,只对选定的特异MS/MS2离子进行质谱信号的采集,从而实现对目标代谢分子更为特异、灵敏、准确的分析。
实验流程(MRM)
使用仪器
常规分析法:agilent UHPLC1290-AB6600
MRM/SRM:agilent UHPLC1290-AB6460
技术优势
常规分析法:高通量分析能力,相比于MRM/SRM简便、经济
MRM/SRM:高通量分析能力,兼具高选择性、高特异性、高准确度、高重现性、高灵敏度、宽动态范围
应用领域
非靶向代谢物组学结果的验证
代谢相关生理、病理研究
发酵工艺研究
食品科学与营养学研究
高通量靶标分析
产品定义
高通量靶标代谢组学分析主要是以标准品为参照,对对某个或某?几个特定组分进行有针对性地、特异性地检测与分析。
使用仪器
常规分析法:agilent UHPLC1290-AB6600
MRM/SRM:agilent UHPLC1290-AB6460
应用领域
非靶向代谢物组学结果的验证
代谢相关生理、病理研究
药物靶标开发
1、靶向代谢组研究根据植物甾醇含量来区分不同葡萄品种
本研究对6个品种葡萄的果肉,果皮以及种子中的甾醇进行靶向代谢组研究。本研究为不同品种之间的鉴别提供了思路。
根据果肉A,果皮B和种子C样品的3D PLS-DA得分图
2、头部和颈部癌细胞的靶向代谢组学研究
本研究通过对UM1癌细胞的干细胞类口腔癌细胞(CSC)和非干细胞癌细胞(NSCC)UM1,UM2,UM5和UM6 头颈癌细胞同时进行靶向和全代谢组学综合分析来研究其差异表型和差异代谢途径。
不同头颈癌细胞中6种靶向代谢物的定量分析
参考文献:
1. Millán L, Sampedro M C, Sánchez A, et al. Liquid chromatography–quadrupole time of flight tandem mass spectrometry–based targeted metabolomic study for varietal discrimination of grapes according to plant sterols content[J]. Journal of Chromatography A, 2016, 1454: 67-77.
2. Hu S, Wang J, Ji E H, et al. Targeted metabolomic analysis of head and neck cancer cells using high performance ion chromatography coupled with a Q Exactive HF mass spectrometer[J]. Analytical chemistry, 2015, 87(12): 6371-6379.