Demo 结果

Demo 结果解读

通过展示不同基因的 ceRNA 的调控机制，从中挖掘出实验组与对照组不同类型的 ceRNA 机制，找到特异性的 ceRNA。线代表不同的 microRNA，蓝色为 mRNA，红色为 circRNA，绿色为 lncRNA。

ceRNA 调控网络介绍

建立了一个计算的机制来使 circRNA(lncRNA) 作为 ceRNA 来保护 mRNA 不受 miRNA 的降解。基于基因的表达值，通过回归模型分析以及种子序列的匹配的方法，建立 microRNA 的海绵吸附作用的调控网络。

分析要求

客户需要提供 microRNA 表达数据（可选），circRNA(lncRNA) 表达；

数据（必选），mRNA 表达数据（必选）；

每组数据 3 个或 3 个以上生物学重复。

提供结果

图片文件（Network 图），包括 png、PDF 格式；

Cytocape 文件：可以 cytoscape 打开进行细节调整；

文本文件：基因之间 ceRNA 调控关系，调控分数，circRNA（lncRNA）microRNA,mRNA 核心调控关系的排序。