从 IPA 的 function 富集结果中不仅可以看到 function 的富集显著性,并且可以得到 function 的激活抑制的信息。
此分析通过 IPA 的 Ingenuity? Knowledge Base 数据库,进行 Fisher 精确检验得到具有显著性意义的 Diseases 和 Bio Functions(Bio Functions 类似 GO),从而可以得到特定实验数据的生物的趋势,并且预测基因表达的改变对生物过程的影响,比如说是减少还是增强。
差异 mRNA 或者关注的 mRNA 基因集;
物种限于人,大鼠,小鼠;
每个基因有对应的差异倍数。
图片格式:function 分类柱状图;
文本格式:function 的富集结果。