通过SDS-PAGE和液质联用技术(LC-MS/MS)对IP所得单蛋白上的修饰位点进行鉴定,可以对目前所有已知的修饰类型及一些特殊的小分子药物在蛋白上的修饰位点进行鉴定。
先通过IP得到目的蛋白,再通过SDS-PAGE对目的蛋白进行分离纯化,将胶条上目的蛋白对应的条带切下进行胶内酶解和高灵敏度的液质联用分析(LC-MS/MS),通过数据库检索得到蛋白上的修饰位点。
Thermo Scientific Q Exactive HF-X
Thermo Scientific Orbitrap Fusion Lumos
Thermo Scientific Q Exactive Plus
Thermo Scientific Orbitrap Fusion
Thermo Scientific Q Exactive
可用于各种修饰类型;
无需对修饰进行富集;
可用于小分子药物与蛋白结合的修饰位点鉴定;
高准确性、项目周期短。
单蛋白修饰鉴定、小分子药物与蛋白结合的修饰位点鉴定、低复杂程度样本中的蛋白修饰鉴定
[1] Tamura K, Fukao Y, et al. Identification and characterization of nuclear pore complex components in Arabidopsis thaliana.Plant Cell.2010; 22(12) 4084-97.
[2] Wang ZQ, Wang L, et al. Proteomic analysis of Trichinellaspiralis proteins in intestinal epithelial cells after culture with their larvae by shotgun LC-MS/MS approach. J Proteomics. 2012; 75(8): 2375-83.