染色质免疫共沉淀(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP)是研究蛋白质与DNA相互作用的经典技术,被广泛应用于转录因子结合位点或组蛋白修饰位点的研究。
云序生物ChIP-Seq服务,将ChIP和高通量测序技术结合,在全基因组范围内高效地检测与特定转录因子或组蛋白结合的DNA位点。
技术优势
优化的ChIP流程:ChIP富集效率是ChIP-Seq成败的关键,云序生物采用商业化ChIP试剂盒和优化的实验流程,确保客户获得优质的数据
严格的质控:云序生物对ChIP-Seq实验的各个环节进行严格的质控,尽可能地降低实验风险
专业的生物信息学分析:强大的生物信息学团队,满足客户的各类深入数据分析需求
数据分析
基本分析高级分析1. 原始数据整理,过滤和质量评估CS-CHI-001. 蛋白结合基因的GO和信号通路分析2. 序列匹配与数据统计CS-CHI-002. 蛋白在样品间差异结合分析3. 图形化展示测序reads的基因组分布CS-CHI-003. 差异结合基因的GO和信号通路分析4. 蛋白结合区域识别(peak calling) 5. 蛋白结合区域注释,分布统计
数据展示
上图:图形化展示蛋白与基因的结合区域
云序生物技术服务列表
1. 测序服务
转录组表观遗传组基因组真核生物原核生物miRNA测序细菌sRNA测序MeDIP测序目标序列靶向测序小RNA测序(miRNA, piRNA,siRNA)原核生物mRNA测序RRBS测序外显子组测序lncRNA测序宏转录组测序全基因组甲基化测序人类基因组重测序环状RNA测序原核生物转录组测序ChIP测序16S rDNA测序mRNA测序原核De novo转录组测序 宏基因组测序RIP测序 降解组测序 转录组测序 De novo转录组测序
2. 生信服务 & PCR技术服务
生信服务实时定量PCR服务转录组表观遗传组基因组联合分析环状RNA分析DNA甲基化分析基因组分析circRNA-miRNA功能分型PCR芯片lncRNA分析ChIP测序分析微生物菌落分析LncRNA-mRNA环状RNA实时定量PCRmRNA分析 宏基因组分析LncRNA-miRNA-mRNALncRNA实时定量PCRmicroRNA分析 miRNA实时定量PCR细菌sRNA分析 mRNA实时定量PCR宏转录组分析