简介：

染色质分为常染色质和异染色质，而常染色质处于松散的开放状态，允许反式作用因子结合顺式调控元件，进而调控基因表达。ATAC-seq 利用tn5 酶切割并捕获染色质开放区域，结合高通量测序和生信分析，可以系统研究全基因组范围内染色质开放区域，是表观调控研究的新方向。

项目流程：
 

康测科技优势：
 

国内核酸-蛋白互作研究服务领跑者，由加州大学圣地亚哥分校（UCSD）、武汉大学、华中农业大学博士后组建的团队，成员已在Nature、Cell、Melecular Cell、Nat.Struct.Mol.Biol等知名期刊发表文章十余篇；

实验流程精简，交付周期更短，性价比更高；

技术重复性好；

全面的多组学关联分析。

部分结果展示：
 

ATAC-seq的应用
 

案例解析

ATAC-seq、ChIP-seq、 RNA-seq关联分析揭示转录因子FOXA1的临床意义
FOXA1是驱动型转录因子(pioneer TF)，其突变能引起一定类别的前列腺癌。 作者通过对3086例原发性和转移性前列腺癌组织样本的调查，发现FOXA1 基因在前列腺癌中存在不同类型的突变,并且通过细胞模型和动物模型证明这些FOXA1基因突变对前列腺癌的发生或转移有促进作用。最后作者通过ATAC-seq、ChIP-seq、 RNA-seq等 技术研究FOXA1不同突变类型的作用机制。发现FoxA1竞争性结合AR调控的基因，并且不同的突变类型造成的结合位点不同，引起的染色质开放区域也不同,导致相关基因表达具有突变特异性。

参考文献: Adams EJ et al., FOXA1 mutations alter pioneering activity, differentiation and prostate cancer phenotypes. Nature, 2019, 571(7765):408-412
具体文章解读可以关注康测科技微信公众号，点击"Nature: 如何选择具有临床意义的基因并揭示其功能”。
 

武汉康测科技有限公司是由加州大学圣地亚哥分校（UCSD）、武汉大学、华中农业大学博士团队创建的高新技术企业。截至2017年底，团队核心成员已在Nature、Cell、Molecular Cell、Nat. Struct. Mol. Biol.、Proc Natl Acad Sci USA、Cell Reports等国际顶级期刊发表文章十余篇。公司秉承技术创新、服务至上的核心理念，与多所985/211院校、中国科学院的实验室建立了长期合作关系。
公司研发团队于2017年成功开发出绝对定量转录组（KC-DigitalRNA）、免疫组库（KC-IRQuant）、16S rDNA绝对定量、ctDNA检测（KC-SMP）等4项建库技术，并成功申请发明专利和配套数据分析系统的软件著作权。成为中国首家UID（UMI）绝对定量高通量测序服务平台，为广大科研工作者提供转录组（mRNA、lncRNA）/TCR/BCR/ctDNA/肠道微生物多样性等多种绝对定量测序服务。