表达谱测序服务
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表达谱测序服务

产品属性

  • 品牌英拜生物
  • 产地上海
  • 型号表达谱测序服务
  • 关注度7
  • 信息完整度
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上海英拜生物科技有限公司

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产品描述

 表达谱测序服务 

    基因表达谱测序为对组织或细胞在特定状态下产生的 mRNA进行高通量测序分析,得到基因差异表达的情况。测序法进行基因表达分析具有定量准确,重复性、特异性、灵敏性高的特点。与全转录组测序研究相比,表达谱测序采用单端或双端读长的策略,测序通量较小,成本较低;与芯片法相比,测序法具有无需样本序列信息即可实现任一物种已知和未知转录本差异研究的开放性特点,对低丰度转录本的检测具有灵敏性和特异性高的优点。客户可根据实验目的,灵活选择合适的测序深度,以达到对不同丰度转录本的检测要求。一般 10M~20M reads数的测序量即可检测到比芯片更多的差异基因。如果对低丰度表达基因的关注度高,建议至少测 30M以上的 reads。
 
1、实验流程
2、数据分析
·         原始数据产出统计
·         数据饱和度分析
·         表达丰度分布统计
·         重复性分析 (需有 2次以上独立的重复实验数据 )
·         样本间共有、特有及差异标签统计
·         标签序列注释
·         基因表达图谱分析
·         基因表达模式聚类分析(不少于两个样品)
·         基因差异表达分析
·         Gene Ontology显著性富集分析
·         Pathway显著性富集分析
 
 
样品要求

样品类型:细胞、新鲜组织或RNA样品。

样品量:细胞样品请提供至少1×107个细胞,组织样品请提供至少100mg的组织块或切片,RNA样品请提供10 μg以上的总RNA。

样品质量:RNA无明显降解,提取的总RNA OD260/280值在1.8~2.2之间,浓度 ≥ 500 ng/μl,28S:18S ≥ 1.5,RIN ≥ 8。

样品保存:细胞样品或新鲜组织块(切成~50mg的小块)可用TRIZOL或RNA保护剂处理或液氮冻存后,-80℃保存。RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中,-80℃保存。样品保存期间避免反复冻融。

样品运输:样品置于1.5 ml管中,封口膜封好,干冰运输。


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