STR介绍
STR(短串联重复序列),又称为微卫星标记或SSR。一般有2-6bp的核心序列串联重复而成,构成了STR基因座的遗传多态性。
STR/SSR具有分布广泛均匀、多态性丰富、遵循孟德尔共显性遗传、信息量大、检测简便等优点,STR/SSR分型高效快捷,结果准确,是非常重要的遗传标记,在遗传制图、连锁性分析、亲子鉴定、疾病基因定位和物种多态性研究等领域有着广泛的应用。
上海翼和生物微卫星分型服务:
根据具体实验规模,提供两种检测平台,分别为:适合中低通量检测的多重荧光PCR STR/SSR分型服务和适合高通量的基于二代测序的Hi-STR分型服务。
多重荧光PCR的微卫星(STR/SSR)分型服务
上海翼和生物采用通用荧光引物方案,多重PCR扩增STR/SSR位点,利用ABI遗传分析仪对荧光标记DNA片段进行检测,利用分子量内标进行DNA片段长度计算,使得微卫星分型变得高效,快捷,结果更加精确可靠。
技术路线:
翼和特色内容多重荧光 STR分型十余年STR分型经验,日产5000个STR分型数据可进行多位点多重反应,经济,高效实验灵活,检出率高,实验周期短分型过程加入荧光标记分子量内标,分型结果准确严格实验流程质控以及10%重复对照设置,保证实验结果重复性检出率>95%准确率>98%
服务流程
A.微卫星(STR/SSR)分型引物筛选
1)客户提供样本以及位点信息;
2)翼和设计相关位点的扩增引物,并合成;
3)预实验抽样小试,摸索并优化反应条件(包括退火温度,镁离子浓度等);
4)3730 XL测序仪电泳
5)Genemapper分析,数据导出;
B.大规模分型实验
1)大规模样本位点扩增;
2)3730 XL测序仪电泳;
3)Genemapper分析,数据导出;
4)交付实验报告,包括实验材料,方法,引物序列等;