BioNumerics生物信息学软件
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BioNumerics生物信息学软件

产品属性

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  • 型号BioNumerics
  • 关注度91
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产品描述
仪器简介:

BioNumerics提供的是一个对生物学实验产生的各种类型的海量数据进行存储、管理和查询,并在此基础上进行亲缘关系分析、聚类分析、数理统计分析及鉴定等的生物信息学软件,帮助研究人员深入挖掘实验结果的深层生物学意义。



技术参数:

 

6组数据处理模块
1.Fingerprint types:可以处理PFGE, AFLP, RFLP, RAPD, REP-PCR, ARDRA, isoelectric focusing,DGGE, TGGE等电泳数据;气相色谱和HPLC数据;DHPLC数据; 分光光度曲线等数据。
2.Character types:可以处理生物抗性实验数据;脂肪酸甲基化脂(FAME)分析数据;生物显性阵列数据;API表型测试数据;微阵列芯片数据;Dot blots和probe sets数据;Spoligo—typing数据;生化试验数据;酶活和代谢活性数据等。 
3.Sequence types:可以处理核酸(DNA或RNA)和氨基酸序列;自动测序仪(Applied Biosystems, Beckman, Amersham)得到的色谱文件;广泛的识别各种序列格式, 包括EMBL, GenBank和Fasta格式。 
4.Trend data types: 处理实时荧光定量 PCR数据;代谢活性和酶活性的动力学数据;微阵列实验中的时间进程数据等和趋势相关的实验数据。 
5.Matrix types:处理DNA同源性相似度的表格数据;DNA杂交数据等矩阵类型数据。 
6.2D gel types:处理双向凝胶电泳试验数据;DIGE试验数据。可以将从2-D胶中鉴定到的蛋白点被直接存储在数据库中。
 
7组数据分析模块
Tree and network inference (clustering):在BioNumerics中通过把关系数据库中的各种记录之间,多种试验之间,用多种有效的聚类算法可以实现多种聚类分析。 
Identification and libraries:根据生物试验数据结果来鉴定未知的生物体或物种,可构建文库。
Molecular analysis tools :蛋白序列等框架分析,限制性酶切分析,zei佳引物与实验组合分析。
Chromosome comparison:染色体比较分析
Dimensioning techniques and statistics:评估各种聚类分析方法的可靠性的技术。
Database Sharing Tools:整合的数据库共享工具。
Audit trails and versioning:记录追踪模块,遵循GMP规范,符合FDA21CFR11电子记录和数字签名要求


主要特点:

BioNumerics是能够以生物学的各种试验数据作为输入数据, 以强大的整合数据库为中心,对生物学数据进行比较,分析,研究的系统。它是在业内著名的凝胶电泳分析软件GelCompar II的基础上整合其他功能而来的,它有以下三个重要特征:

1.数据管理:提供对指纹类型、2D胶类型、序列类型、字符类型、矩阵类型、曲线和动力学描述类型等所有生物学数据存储,提取,搜索功能,非常适合做生物实验室数据管理的核心。
2.数据分析:通过对数据进行比较筛查,分析数据之间的不同点和相似性,从而将数据进行分类,定义,和统计学分析,并可用来鉴定未知的生物体。BN分析功能的独特之处在于它可以综合不同实验方法的的结果,给用户一个可靠的结论。
3.网络共享:使用BN提供的网络共享功能,在指定的网络里,用户之间可以方便地交换共享生物数据,并能导入互联网上知名的专业数据库。

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