MetaCoreTM是一个整合的套装分析软件，主要用来对各种类型的高通量的生物实验数据进行功能分析，包括生物芯片数据、代谢组学的数据、基因序列表达分析技术(SAGE)、蛋白组学数据、小分子RNA分析以及数据挖掘等功能。MetaCoreTM的分析平台是基于一个独特的、申请专利的、高质量的人工修正的数据库，其中包括各种蛋白-蛋白和蛋白-DNA相互作用网络、各种转录因子、信号转导和代谢反应通路以及各种生物活性分子的数据。这个数据库整合了“数据挖掘”工具包，能够对各种数据可视化、数据的分析和交换，提供多种网络构建算法、芯片数据的过滤等。整个分析以流程的方式进行，便于操作。

• 几十万个蛋白相互作用，并标记蛋白作用方向和机制
• 几百万个基因、蛋白和化合物数据库
• 700余种人工修正过的通路图谱
• 40000余种代谢反应
• 3122种药物信息
• 900余种转录因子
• 5000余种内源性的代谢物
•  800,000余种化合物