Omni家族芯片
Omni芯片家族自2009年上市以来,已经提供了一系列灵活的芯片,它们带来了精选自国际HapMap计划和千人基因组计划的常见和稀有变异。有了Omni芯片家族,研究人员能够立即开始新一代GWAS、基因分型和比较基因组研究。
注:Omni家族芯片同款一般有两种类型:一种是芯片的SNP位点固定,另一种是可自定义添加SNP位点。自定义位点是在芯片SNP位点基础上,可自定义添加最大位点数,N/A表示不能添加。
Human Omni ZhongHua-8 BeadChip芯片服务 (推荐!)
特别覆盖中国人特有的常见和稀有变异
人类种群特异的全基因组芯片,经过优化的标签SNP内容来自HapMap所有三个阶段以及千人基因组计划(1kGP),可用于在中国人种群中探索全新的疾病和性状关联。
特别覆盖中国人81%的常见变异(MAF> 5%)和60%的稀有变异(MAF > 2.5%),适合全基因组关联研究(GWAS)。
采用Illumina专利的BeadArrayTM技术,可提供非常高的数据质量,平均检出率> 99%,重复率> 99.9%。
HumanOmni5-Quad芯片服务(推荐!)
人类变异的高密集覆盖
4个样品的Omni5芯片特有超过430万个标记物/样品。
特有来自千人基因组计划的新颖、常见和稀有变异。除了提供人类变异(MAF低至1%)的密集覆盖,覆盖了基因组中与疾病关联的高价值区域,包括基因区域、MHC区域和非同义SNP。
特有来自千人基因组计划的近5000个插入缺失和多碱基替换标记物,能帮助研究人员阐明结构变异如何影响性状和疾病。
可自定义的 500K位点让研究变得更具灵活性,可以方便更高密度靶定基因组的特定区域。
动植物全基因组分型芯片解决方案
SBC同时可提供Illumina合作者基于Infinium技术研发的苹果,梨,樱桃,番茄,马铃薯,山羊SNP芯片等。
Illumina定制SNP芯片
iSelect 定制芯片平台
Infinum采用了Illumina专利的InfinumHD检测技术,为每一个SNP位点设计一个微珠,反应通过50个碱基的探针和样品杂交,并通过末端单碱基延伸完成,末端双色标记(Cy3,Cy5)来检测该位点的等位基因情况。充分保证了检测的高灵敏性和特异性以及准确性。反应无需PCR,不依赖于限制性内切酶,无需电泳,保证了高质量的数据。
高通量的Infinium检测技术,检出率高;
除了SNP外,还可以针对拷贝数变异(CNV)进行设计;
任意物种、任意位点随意组合。
iSelect技术原理(来源:illumina官网)
GoldenGate定制芯片平台
Illumina专利的GoldenGate技术是理想的中等通量自定义芯片技术,不仅可以定制SNP基因分型和拷贝数变异(CNV)检测芯片,还可以定制DNA甲基化芯片。
低成本的中等通量基因分型解决方案
方法经典可靠,为HapMap计划主要应用平台
数据质量高,平均响应率﹥99%
定制灵活
GoldenGate技术原理(来源:illumina官网)
科研工作者除可利用HapMap,dbSNP等数据库挑选SNP位点外,Illumina可免费对客户提供的rs号,基因名称,序列或要研究的区域的位置进行生物信息学分析,挑选SNP位点并进行位点实验成功率评分,评分结果返回用户处后和用户沟通一起来确定要进行研究的SNP位点,以合成探针组(OPA),进行基因分型的研究。一个样品可以同时进行96,384,768、1536或3072个SNP位点的研究。
目前,SBC已经完成的GoldenGate定制SNP芯片项目物种有:人,大豆、鱼等。
Illumina SNP芯片服务应用案例
Illumina Human1M-Duo beadchip array
JOURNAL OF CLINICAL ONCOLOGY:HLA-DRB1*07:01等位基因是拉帕替尼诱导的肝损伤风险增加的预测因子
Illumina Human 610-Quad BeadChips
发现汉族人红斑狼疮易感基因
简介
SBC与南方基因中心的合资子公司南方基因科技有限公司于2003年引进了美国Illumina微珠基因分型分析系统,成为全世界第三个拥有该高通量检测 平台的单位,参加了国际Hapmap计划,承担了中国区的主要任务,各项技术指标名列全球之首。在承担国际计划之余,该平台还承担了多项国际、国内疾病基因组重点科研项目。
上海伯豪生物技术有限公司(上海生物芯片有限公司全资子公司,生物芯片上海国家工程研究中心)为您提供完善的Illumina芯片服务。
产品的简要介绍如下,详细信息请查看生物服务在线网站(www.ebioservice.com)。
Illumina 人SNP芯片服务
芯片推荐:Illumina Human1M-duo beadchip
芯片内容:Illumina Human 1M- duo芯片中包含了超过一百万个探针信息,可以在一张芯片上平行进行2个样本的检测。该款芯片门包含针对基因SNPs,标签SNPs,拷贝数变化(CNV),及其他高价值的基因组区域设计探针,同时还增加了一些新的位点,如:增加了疾病相关的SNP位点,灵活的选择一些基因组编码区高密度的SNP 位点。
芯片推荐:Illumina Human 660w-quad beadchip
芯片内容: 该款芯片在一张芯片上可平行进行4个样品的检测,显著的增加了样本输出信息量,减少了实验操作中的误差。该芯片广泛地采用了HumanHap550芯片的内容,以及额外增加了100,000个遗传标记。Human 610-quad涵盖的全基因组信息,对于已知的和新近报道的CNV区域来说都具有权威性。 Human 660w-quad上的SNPs以约5kb的密度均匀分布在基因组上。针对于基因组中高多态性的CNV区域(片段复制区和无SNP的基因组区域),Human 660w-quad设计了一些特异的靶标来进行研究。
芯片推荐:Illumina Human Exon 510S-Duo
芯片内容: Human Exon 10S- Duo包含了约510000个标签SNP。其中330000个标签SNP偏重于基因中央的SNPs和nsSNPs,其他一些有研究价值的标签SNP主要针对于新近报导的CNV区域,与药物代谢有关的基因区域和MHC区域。Human Exon510S-Duo同样可以在一张芯片上平行进行2个样本的检测。 Human Exon510S-Duo是HumanHap 550-Duo的辅助产品,将这两款产品联合使用则能提供相当于Human 1M的全部SNP 信息。
Illumina 其它物种SNP芯片服务
牛全基因组分型芯片服务(Illumina BovineSNP50 Genotyping BeadChip)
犬全基因组分型芯片服务(Illumina CanineSNP20 Genotyping BeadChip)
马全基因组SNP分型芯片服务(Illumina EquineSNP50 Genotyping BeadChip)
猪全基因组SNP分型芯片服务(Illumina PorcineSNP60 Genotyping BeadChip)
羊全基因组SNP分型芯片服务(Illumina OvineSNP50 Genotyping BeadChip)
肿瘤相关SNP芯片服务
主要组织相容性研究芯片服务