Illumina针对人、小鼠的完整RNA样本开发了全基因组表达谱芯片产品(采用直接杂交的方法),还针对人降解RNA样本(例如FFPE样品)开发了基于DASL技术(cDNA介导的退火、选择、延伸和连接)的表达谱芯片产品。
人表达谱芯片服务
HumanHT-12 v4 Expression BeadChip
超过47,000个探针,覆盖31,000多个注释基因,可同时检测12个样本。信息来源RefSeq 数据库( Release38,2009年11月7日),UniGene 数据库(Build 199)。
小鼠表达谱芯片服务
芯片名称 | 样本/芯片 | 转录本数 | 参考数据库 |
MouseRef-8 v2 Expression BeadChip | 8 | 约25,600个转录本 | NCBI RefSeq(Build 36, Release 22) |
MouseWG-6 v2 Expression BeadChip | 6 | 约45,200个转录本 | NCBI RefSeq(Build 36, Release 22);RIKEN FANTOM2;MEEBO |
基于DASL技术的表达谱芯片服务
Human Whole-Genome DASL HT Assay BeadChip
Human Whole-Genome DASL(cDNA介导的退火、选择、延伸和连接)Assay是唯一一个能从低丰度或部分降解的人RNA样本中产生全基因组表达图谱的优化整合系统,特别适用于那些来自甲醛固定石蜡包埋(FFPE)组织的RNA样本。
Human Whole-Genome DASL HT Assay BeadChip覆盖约24,000个转录本。信息来源RefSeq 数据库(Build 36.2, Release 22)。
DASL技术优势:
灵活的RNA表达谱分析:可使用细胞系、新鲜或冷冻组织、以及FFPE组织样本
灵敏度高:可以FFPE组织、脑组织、包含球蛋白的血液、或低至100个细胞起始
起始样本量低:10-100ng来自新鲜或冷冻组织的总RNA或50-200ng来自FFPE
高质量的结果:与RT-PCR的结果高度一致(r2≈0.85)
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