Ion Personal Genome Machine® (PGM™) System二代测序
Life ion torrent相关应用:
1.DNA & Genome Sequence Analysis
2.Epigenetic Sequencing Analysis
3.Fragment Analysis
4.Genotyping & Genomic Profiling
5.Ion Semiconductor Sequencing
6.RNA & Transcriptome Sequence Analysis
特点
1.运行成本经济可行
2.序列读长长:平均可达400-500个碱基
2.运行快:仪器单次运行 数据处理时间短
3.准确度高:超过400个碱基的单个序列阅读准确度高于99%
4.获得的数据量大:平均可获得10,0000条数据, 35Mb数据
5.适合样本广泛。基因组DNA、扩增产物、cDNA或BAC等都可。且无需建库。
6.支持的测序方法多样:如鸟枪法(Shotgun)、配对末端(Pair-End)测序及扩增子变异分析
7.可应用的领域广泛
• 环境样品的宏基因组鉴定
• 微生物基因组测序
• 病原体检测
• 人类目标序列重测序
• 扩增子直接克隆测序(PCR产物)
• 传染病源快速鉴定
• 转录组研究
• 肿瘤基因组和突变
• DNA甲基化
• 基因表达
• 细菌人工染色体
• 人体基因组结构和突变
• 染色质免疫沉淀
• 考古学
样品类型 |
NGS 分析项目 |
全血 |
白血病 |
血浆 |
HIV, HCV |
石蜡切片 |
黑色素瘤, 肺癌, 结肠癌 |