采用稳定同位素标记定量的方法，能够精确的对蛋白表达水平进行定量分析。然而，标记定量的方法也存在某些不足之处：包括，额外的样品处理过程，昂贵的标记试剂，不完全标记导致样品复杂化，低丰度多肽难以检测，可标记样品数量有限等。作为替代，非标记定量技术（LFQ，label-free quantification）能够避免此类缺陷。LFQ定量通常可采用两种方式：（1）谱图计数法（Spectral counting），使用多肽被鉴定次数来代表对应多肽的相对含量，进而计算出对应蛋白的相对表达量；（2）母离子强度（precursor ion intensity），提取鉴定到的多肽在一级质谱（MS1）中的色谱峰面积代表其相对含量，然后计算出对应蛋白的相对表达量。和标记定量技术不同在于：标记定量样品预先混合并同时进行LC-MS/MS检测，而LFQ技术要求每个样品独立进行制备和LC-MS/MS检测，因此准确性和通量弱于标记定量技术。

图1. Label-free定量技术原理。

技术优势
● LFQ定量技术克服了同位素标记定量技术的诸多限制，更加灵活，适用于各种样品；更高的灵敏度，定量更多的蛋白。
● 特异性与灵敏度兼备：基于质谱的蛋白质组学精确到单个氨基酸位点，蛋白鉴定准确，灵敏度高，是profiling分析和PTM研究的强大工具。
● 严格的质量控制：数据稳定、重现性好，定量动态范围广，多个样品平行处理，接近标记定量的定量准确性。
● 专业的数据分析：标准的搜库流程，专业的统计和生信分析，出版级的图表展示，完整全面的分析报告。

样品要求