代谢组学服务UPLC­­­---Q-TOF LC/MS 
 
声明：为保护客户的权益与保密协议，在保证实验结果真实有效的前提下，我们对实验的数据进行了适当的变动处理，简化了实验流程及采样数量。请勿转载！责任自负！
 
使用仪器：液-质联用
UPLC­-----Agilent 1290
Q-TOF LC/MS------ Thermo Orbitrap Elite( 分辨率> 240,000 FWHM)  或Thermo  QE
 
样品信息：
患病组血清样品vs.对照组血清样品
 
实验流程：
通过UPLC­­­----Q-TOF LC/MS分析，分析患病组和对照组血清样品代谢成分，获得代谢组分的实验数据。利用数学分析方法寻找患病组和对照组中具有差异性的代谢组分，建立未知样本分析模型。
 
实验步骤：
 

一、采样
对样本来源进行分组，并记录性别、年龄、病情、治疗等信息；
采集全血，离心后获得血浆/清样本，于-80℃冰箱中保存。

血浆/清样本用提取液（甲醇-乙***）沉淀蛋白，并于-20℃下提取化合物1 h；高速离心后取上清液，经真空抽干后复溶于甲醇溶液。


二、仪器分析及数据预处理（信息峰的提取和识别）


图一  人血清样品典型的LC／MS总离子流图(TIC, ESI+，m/z 60–1000.)



三、数据分析

 
图二：主成分（PCA）得分图：每个点代表一个样本，对照组和患病组样本在CA空间可以明显的分为两组

  
图三：偏zei小二乘法判别分析（3D PLS-DA，S-Plot），寻找候选生物标志物，可用于疾病诊断和模型识别



四、差异代谢物鉴定

图四：高分辨率MS/MS鉴定，右图是左图（一级质谱结果）单峰的二级质谱结果

 


另：生物信息学服务内容：后期数据分析及挖掘
 
 A、疾病识别，诊断模型
 
 B、系统生物学分析

   图五：疾病潜在生物标志物的代谢通路分析，阐释发病机制和生命现象