技术特点:
l 对液相色谱串联质谱的稳定性和重复性要求较高
l 无需昂贵的同位素标签做内部标准,实验耗费低
l 对样本的操作也zei少,从而使其zei接近原始状态,并且不受样品条件的限制,克服了标记定量技术在对多个样本进行定量方面的缺陷。
图:蛋白质组高通量测序流程图(含label-free定量)。
应用领域
l 免疫沉淀方法制备的蛋白质混合物鉴定
l Pull-down方法制备的蛋白质混合物鉴定
l 某一生理状态下组织、细胞或细胞器中所有表达蛋白质鉴定
信息分析内容
l mascot数据库检索,结果可靠性评估和过滤;
l 鉴定结果质量评估、重复性分析;
l GO功能注释、Pathway 代谢通路注释;
l GO富集、Pathway富集;
l 样品间label-free定量,差异表达分析。