单细胞全基因组测序是在单细胞水平对全基因组进行扩增与测序的一项新技术。其原理是利用MDA或MALBAC技术对分离的单细胞中微量全基因组DNA进行高效扩增,获得高覆盖度的完整基因组后进行高通量测序,生物信息学分析获得细胞中的遗传变异信息,可用于揭示细胞群体差异和细胞进化关系。
样品要求
1) 细胞分离:由合作方完成单细胞分离;
2) 由公司寄出样品保存液(MALBAC——裂解液;MDA——PBS缓冲液);
3) 样品需求量:1-1000个新鲜细胞,样本体积尽量不超过1-2μl。
其他要求
1) 直接使用公司提供的0.2mL平盖PCR管作为采集管,管盖标注编号;细胞样本需采用不含Ca2+、Mg2+的缓冲液洗涤;裂解液避免反复冻融。注意避免起泡;
2) 操作过程中请尽量将采样管置于低温环境下(如冰上)。 样本采集管需要用Parafilm封口膜缠绕封口,装入PCR管盒,橡皮筋固定,再装入自封袋,-80℃暂存,大体积干冰运输;防止液体状态下管身颠倒使细胞附于采样管内壁上部;
3) 送样量:单细胞基因组扩增,建议重复单细胞样本个数不小于3个;
4) 细胞采样后,请置于96孔管盒中,避免采样管倾倒,尽快寄送,若需保存请置于-80℃。