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武汉达邦生物科技有限公司

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技术简介:

SSR(Simple Sequence Repeats)标记是一种以特异引物PCR为基础的分子标记技术,也称为微卫星DNA(MicrosatelliteDNA),又称为sequence tagged microsatellite site,简写为STMS,是目前zei常用的微卫星标记之一。

SSR是由几个核苷酸(一般为1~6个)为重复单位组成的长达几十个核苷酸的串联重复序列。由于每个SSR两侧的序列一般是相对保守的单拷贝序列,因而可以将微卫星侧翼的DNA片段克隆、测序,然后根据微卫星的侧翼序列就可以人工合成引物进行PCR扩增,从而将单个微卫星位点扩增出来。

实验内容:

1.引物设计与合成;

2.目的片段PCR扩增;

3.上机电泳;

4.结果统计。

提供材料:基因组DNA≥20μl,浓度≥50ng/μl)。需提供目的SSR位点的rs号或该位点上下游各200bp的序列以及突变的类型。

交付结果:

1.完整实验流程报告;

2.LI-COR4300电泳胶图;

3.样品对应SSR位点的基因型(重复序列)。

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