App Chip-07 DNA甲基化芯片解决方案

高密度的升级版 Human 450K 甲基化芯片实验服务与配套下游综合数据分析服务将围绕DNA甲基化组进行系统的生物学问题的探索。

表观遗传学标记（Epigenetic marks）是由酶介导的DNA和相关染色质蛋白的生物化学修饰。尽管表观遗传标记不能改变DNA序列，但他们包含着遗传讯息并在调控基因组功能中发挥重要的作用。这类标记包括：胞核嘧***甲基化（cytosine methylation），组蛋白尾端和组蛋白核心的转录后修饰，以及核小体定位（nucleosomes positions）。他们影响着转录状态和染色质的其他重要功能，例如：DNA甲基化和某些组蛋白H3 N端尾端的残基对转录基因的沉默和异染色质的形成起到关键性作用。这些标记针对具有细胞毒害作用的非编码基因序列的沉默，包括转座子（transposons）,假基因（pseudogens）,重复序列（repetitive sequences），以及整合的病毒而言就会被激活。表观遗传上的基因沉默在发育现象中，包括植物和动物中的印记基因现象，以及在细胞分化和重编程过程都中发挥重要的作用。 

 

研究内容

DCAM-01：DNA甲基化芯片原始数据的预处理

DCAM -02：DNA甲基化芯片相关性与重现率（重复率/相关性）分析

DCAM -03：DNA甲基化芯片的处理组-对照组相关性评估

DCAM -04：甲基化/非甲基化位点（基因）Fisher和Pearson卡方统计检验

DCAM -05：样本组间的甲基化趋势差异分析

DCAM -06：样本组间的甲基化趋势（非监督/监督式）聚类分析

DCAM -07：基于甲基化谱构建疾病预后、诊断预测模型

DCAM -08：差异化甲基化位点临近基因生物通路分析

DCAM -09：差异化甲基化位点临近基因生物学功能注释

DCAM -10：DNA甲基化趋势与基因表达调控的关联分析

DCAM -11：DNA甲基化差异位点邻近启动子区调控基序（motif）的识别

DCAM -12：DNA甲基化趋势在TSS邻近区域的分布特征

DCAM -13：DNA甲基化趋势在基因组染色体上的分布特征

DCAM -14：MeDIP芯片技术与甲基化综合数据分析 

更多详情：http://www.biogenius.cn/htm/solution/Biochip/78.html

 

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