CSAM-06:ChIP-Seq 转录因子结合位点的基序分析
为了解蛋白结合 DNA 位置序列(例如转录因子 DNA 结合位点,称为 TFBS )的特异性,本方案将对蛋白因子的强结合峰值上下游 100bp 区间内序列进行从头探测( Motif 识别)。对于调控 DNA转录的蛋白因子而言,每个转录因子可能会发现一组不同的结合序列 motif ;通过不同转录因子的motif 分析,可能会发现转录因子共调控的 TFBS 特征。如果蛋白结合序列来自 DNaseI-Seq 数据与ChIP-Seq 数据相结合的分析结果,本身就提供了更可靠的蛋白结合位点的序列结构。
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