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RSAM-09 长非编码RNA研究：lncRNA-protein相互作用分析

lncRNA可能参与：（1）以编码蛋白的转录本序列互补的反义链形式相互作用于靶序列上，起到顺式调控的作用；（2）结合与转录本可变剪接点位置，影响可变剪接体复合体的形成与作用，进而决定转录本、基因的可变剪接形式和产物蛋白质的结构和功能；（3）以反式调控形式，与蛋白质相互作用靶向于作用位点形式激活或抑制基因转录等功能。（4）转录自正常转录本序列，或同上下游基因一同转录，产自pre-miRNA或者基因间区；可能被加工成sRNA形式参与sRNA调控机制；并与共转录的转录本基因存在反馈式调控关系网络。lncRNA的命运也多种多样，即可以编辑成small ncRNA，可以结合蛋白质发挥作用；也可以直接作用与靶基因，起到转录调控的作用。

基于对蛋白质组学的研究，本模块可探索lncRNA-protein相互作用关系，全面解析lncRNA的复杂调控规律。依据已知蛋白－RNA相互作用数据库（PRIDB），可采用多种蛋白-lincRNA相互作用方法预测lincRNA中存在的蛋白结合位点以及蛋白结构域（RNA-binding protein domain）。