良好的兼容性

PeakTrace/Lontrace DNA序列分析系统适用于ABI 377，310，3700，3730，3730xl，3100和3130系统。

 

 

操作方便

   直接将KB Basecaller分析的trace(扩展名为abi 或ab1的文件)导入PeakTrace/Lontrace DNA序列分析系统，经过短时间处理，系统将自动生成与处理前的trace同名的文件，并存入预先指定的文件夹中（注意：不要将处理结果与KB Basecaller分析的trace存入同一个文件夹）。

 

 

更高的读长，更少的错误

     PeakTrace/Lontrace DNA序列分析系统从ABI KB Basecaller分析的trace中提取出原始数据，通过一系列zei新算法从头处理，能显著提高测序读长，减少错误，提高通量。  

 

 

 

, ABI KB Basecaller 和PeakTrace分析结果的比较

 

 

 

ABI KB Basecaller 和LongTrace分析结果的比较

A: KB Basecaller分析结果

B: LongTrace分析结果分析结果

 

 

 

 

常见问题

 

1. 很多数据读长超过800bp之后，分辨率比较低，经过  PeakTrace/Lontrace 重新分析后，能将读长增加10-200bp，使读长甚至超过1000bp，显著提高分辨率，那么增加的读长部分，比如800－100bp的部分，从分析后的峰图上看起来很准确，实际上这些数据可信吗？

 

   经过PeakTrace/Lontrace重新分析的数据，增加的读长部分的碱基序列是可信的，可信度都是用Qscore来评价，可以在系统中进行设置，默认条件下是20，即进行basecalling的错误概率低于1％；如果要求更高，可以设置成为30，则进行basecalling的错误概率低于0.1。

   通过实验也能进行验证，比如用序列拼接或者对DNA片断进行反向测序，用实验数据和系统重新处理的结果进行比较即可。目前，该系统已在国内外很多知名的实验室使用。  

 

 

2. PeakTrace和LonTrace 有什么区别？

 

  PeakTrace和LonTrace都是提取原始数据重新进行数据处理， 区别在于PeakTrace进行 basecalling的方法是采用公司自主开发的新算法；而LonTrace是仍然采用KB Basecaller进行basecalling。所以，从处理之后的结果来看，PeakTrace处理之后的峰图的形状变化更大，优点是分辨率改善更明显。 ,,,