转录组测序是基因结构和功能研究的基础。基于新一代高通量测序技术的转录组测序,已广泛应用于生物学研究、医学研究、临床研究和药物研发等。与表达谱研究相比,转录组测序除了可对转录本进行更加准确的定量外,还可进行更为复杂的序列分析,如新转录本和罕见转录本发现、cSNP和InDel鉴定、可变剪切鉴定、染色体重排鉴定、lncRNA和UTRs鉴定等,获得更为精确完整的基因功能图谱和突破性的发现。
◇ 服务项目:
1)测序:对客户提供的样本进行RNA抽提和质检,检测合格后进行RNA样品制备、测序文库构建、测序。
2)数据处理:对原始数据进行去除接头、污染序列及低质量reads的处理,并统计reads的长度分布、Reads数量、数据产量。
3)标准数据分析:无参考基因组的转录组分析(De novo Transcriptome Analysis);有参考基因组的转录组分析(Transcriptome analysis with reference genome)
◇ 服务流程:
样品抽提与质控,保证获得高质量的RNA(2ug)或DNA(20ug)→文库构建→测序→拼接组装BLAST→功能注释。
◇ 您只需提供:
1)细胞、新鲜组织或RNA样品。
2)细胞样品请提供至少1×107个细胞,组织样品请提供至少300mg的组织块或切片,RNA样品请提供10 μg以上的总RNA。
3)要求RNA无明显降解,提取的总RNA OD260/280值在1.8-2.2之间,浓度 ≥ 500 ng/μl,28S:18S ≥ 1.5,RIN ≥ 8。
◇ 我们提供:
实验方法报告单和标准的数据分析报告。
◇ 实验周期:6-8周。
◇ 收费标准:询价。