肠道菌群在维持机体正常功能中的作用已经越来越受到重视，最近研究发现，肠道菌群可以调节机体的情绪、认知、疼痛和睡眠等，并与阿尔茨海默病、帕金森、焦虑抑郁和孤独症等多种疾病密切相关，也是多种神经系统疾病发生和发展的关键调节者，相关领域的研究如火如荼，取得的成绩斐然。

宏蛋白质组学是一门新型科学，它运用质谱技术规模化地采集自然界微生物种群的蛋白质信息，并结合多种组学数据，开展微生物种群的遗传特征及其生物功能的研究。

实验流程

应用领域

案例分析

肠道微生物菌群的改变与炎症性肠病(IBD)的发病机制有关，但介导宿主-微生物群相互作用的因素尚不清楚。本文应用宏蛋白质组学技术对来自儿科IBD患者粘膜腔样本进行了人和微生物菌群蛋白特征的分析。结果发现，与氧化应激反应相关的微生物蛋白在IBD病例中上调。特别是在IBD病例中，与氧化抗菌活性相关的人类蛋白表达增加，并与微生物功能的改变相关。此外，还发现这些人类蛋白中有许多存在于分离的游离细胞外囊泡(EV)中，并显示出丰富值的改变。最终结果表明肠外囊泡蛋白组的改变与IBD中宿主-微生物群的异常相互作用有关。

参考文献

[1]. Zhang, X., Ning, Z., Mayne, J., Moore, J. I., Li, J., Butcher, J., et al. (2016). MetaPro-IQ: a universal metaproteomic approach to studying human and mouse gut microbiota. Microbiome 4:31. doi: 10.1186/s40168******

[2]. Aron-Wisnewsky, J., and Clément, K. (2016). The gut microbiome, diet, and links to cardiometabolic and chronic disorders. Nat. Rev. Nephrol. 12, 169–181. doi: 10.1038/nrneph.2015.191

[3]. Haange, S. B., and Jehmlich, N. (2016). Proteomic interrogation of the gut microbiota: potential clinical impact. Expert Rev. Proteomics 13, 535–537. doi: 10.1080/14789450.2016.1190652