利用自然群体、人工群体作为研究材料，基于重测序的信息，结合代谢组结果，进行代谢组的全基因组关联分析（metabolome Genome-Wide Association Study, mGWAS），批量、精准定位候选基因，挖掘代谢生理、表型相关的功能基因，阐释相关pathway分子、生化机理。mGWAS利用代谢物作为数量性状与基因组变异位点进行关联分析，在分析过程中，通常检测到的代谢物数量多（＞400种代谢物）、差异大（10-10000倍）、遗传效应高（解释超过40%变异），得到的结果因此优于传统表型性状GWAS。