Small RNA测序
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Small RNA测序

产品属性

  • 品牌凌恩生物
  • 产地上海
  • 型号Small RNA测序
  • 关注度12
  • 信息完整度
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产品描述

小RNA是生物体内一类具有重要调控功能的非编码小RNA的总称。大量研究已经证实,小RNA几乎参与调控了动植物几乎所有的生命过程,包括细胞增殖,分化,凋亡等,并且与人类疾病的发生发展密切相关。小RNA测序正是对这一类重要的调控小RNA展开分析,利用高通量测序技术对样本中18~30 nt的小RNA序列进行鉴定和分析。依托联川生物强大的生物信息分析平台,可以快速鉴定物种已知小RNA,并预测新的小RNA,同时可对小RNA的靶基因进行预测和功能分析。

技术流程

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分析流程

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技术优势

  • 通量高,单样本数据量20M;

  • 流程优化,项目周期显著降低;

  • 可开展全转录组关联分析,深入挖掘基因表达状态和转录组水平表达调控状态;

  • 提供组学数据构建服务,让数据后期利用更加便利。


送样要求

  • RNA总量:RNA总量≥2ug;

  • RNA纯度:OD260/280在1.8-2.0之间,核酸完整无降解,完整性RIN≥8.0;浓度≥100 ng/μL。


分析示例

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small RNA序列长度分布



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表达差异基因聚类图


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上下调差异基因GO注释柱形图



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差异基因KEGG富集图


项目经验(近期客户文章)

1. Generating Homo- and Heterografts Between Watermelon and Bottle Gourd for the Study of Cold-responsive MicroRNAs. Journal of Visualized Experiments(IF=1.108),2019.

2. Methylation interactions in Arabidopsis hybrids require RNA-directed DNA methylation and are influenced by genetic variation.PNAS (IF=9.423),2016

上海凌恩生物科技有限公司

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