小RNA是生物体内一类具有重要调控功能的非编码小RNA的总称。大量研究已经证实,小RNA几乎参与调控了动植物几乎所有的生命过程,包括细胞增殖,分化,凋亡等,并且与人类疾病的发生发展密切相关。小RNA测序正是对这一类重要的调控小RNA展开分析,利用高通量测序技术对样本中18~30 nt的小RNA序列进行鉴定和分析。依托联川生物强大的生物信息分析平台,可以快速鉴定物种已知小RNA,并预测新的小RNA,同时可对小RNA的靶基因进行预测和功能分析。
技术流程
分析流程
技术优势
通量高,单样本数据量20M;
流程优化,项目周期显著降低;
可开展全转录组关联分析,深入挖掘基因表达状态和转录组水平表达调控状态;
提供组学数据构建服务,让数据后期利用更加便利。
送样要求
RNA总量:RNA总量≥2ug;
RNA纯度:OD260/280在1.8-2.0之间,核酸完整无降解,完整性RIN≥8.0;浓度≥100 ng/μL。
分析示例
small RNA序列长度分布
表达差异基因聚类图
上下调差异基因GO注释柱形图
差异基因KEGG富集图
项目经验(近期客户文章)
1. Generating Homo- and Heterografts Between Watermelon and Bottle Gourd for the Study of Cold-responsive MicroRNAs. Journal of Visualized Experiments(IF=1.108),2019.
2. Methylation interactions in Arabidopsis hybrids require RNA-directed DNA methylation and are influenced by genetic variation.PNAS (IF=9.423),2016