细胞器亚细胞结构蛋白质组学

亚细胞是蛋白质组学研究的重要方向，是在原有基础上将研究目标进一步细分，有助于更细致、深入地了解不同亚细胞结构的蛋白对各种因素的响应。
相对于以往常规蛋白组学研究，这些新颖的研究方向对蛋白质组技术特别是样品制备技术提出了更高的要求。

技术特征

可分析亚细胞种类丰富
目前可以提供线粒体、叶绿体、细胞质等各类主要细胞器的定量蛋白组实验。
并且还在不断开发高尔基体、内质网等小细胞器的分离和蛋白质提取技术，努力拓展细胞器蛋白质组学的服务范围
功能蛋白的精准定位
蛋白的亚细胞定位对于蛋白生物功能的发挥起到关键作用，
进行细胞器蛋白质组学研究有利于加快细胞分子生物学机制的理解
特异性蛋白的发现
细胞器蛋白质组学研究通过细胞器分离富集技术与经典蛋白组技术的有效结合，可以有效去除其它细胞器蛋白的干扰，
特异富集目标细胞器专属蛋白，增强对目标细胞器所属低丰度表达蛋白的检测，大大提高蛋白检测的灵敏度

案例展示
案例一   研究辣椒疫霉菌对番茄侵染过程的相关机制

实验材料
番茄叶片（ 8 h、24 h辣椒疫霉菌侵染组和未侵染组）
研究流程

研究结论
差异蛋白的GO分析结果表明，部分细胞核及其进程相关蛋白以及过氧化物酶等非核蛋白可能在疫霉菌侵染过程中被改变
AHL（AT-HOOK-LIKE）蛋白家族可能起到关键作用
通过进一步实验验证，验证了AHL作为调控因子，在针对辣椒疫霉菌侵染的免疫过程中发挥作用

参考文献
Howden AJM. et al., Quantitative analysis of the tomato nuclear proteome during Phytophthora capsici infection unveils regulators of immunity., 2017, New Phytologist.