简介
转录组狭义讲是所有 mRNA 的集合, 它是在整体水平上研究细胞中基因转录的情况及转录调控的规律,是研究表型和功能的一个重要手段。蛋白组是某种生物所能表达的所有蛋白质,蛋白质是生命功能的执行者,转录组学告诉人们细胞中可能发生的行为,蛋白质组学告诉人们细胞中正在发生的行为。
技术流程
技术特征
可以发现大量蛋白特有的翻译后修饰、信号肽等信息
可以进行新基因的批量发掘以及预测基因的批量校正
覆盖范围广,能在较短时间内对基因组进行全面深入解析
案例展示
案例一 蛋白组和转录组联合分析揭示丙酮丁醇梭菌代谢应激反应后的调控机制
实验材料
丁酸梭菌分别受丁酸与丁醇胁迫处理丁酸梭菌样本
研究流程
研究结论
iTRAQ鉴定到616种蛋白,覆盖15%基因组
31%差异蛋白与转录组表达趋势相反,揭示大量翻译后调控
应激条件下翻译机制有所不同
5’UTR具有蛋白翻译调控功能
蛋白转录联合能够揭示复杂的表达模式
参考文献
Keerthi P. Venkataramanan. et al., Complex and extensive post-transcriptional regulation revealed by integrative proteomic and transcriptomic analysis of metabolite stress response in Clostridium acetobutylicum. 2015, BIOTECHNOL BIOFUELS. (IF:5.497)