产品简介
群体进化是通过对种内不同生存条件下的不同亚群的代表性个体进行全基因组重测序,基于群体遗传差异,分析导致不同亚群适应性进化的基因组层面的特异变化。亚群之间的遗传差异变化也能反映出各自的动态变化及相互之间的影响。对于筛选到的受选择压力作用的基因组区域,通常是重要的功能区域,对于理解功能对环境的适应有重要指导意义。
应用领域
•人工驯化机制研究;
•自然选择机制研究;
•种群历史的研究。
产品优势
•90个工作日即可获得全部信息分析结果;
•多种序列多样性参数(π、ZHp、ZFst、qw)分析,结果更准确;
•丰富的物种经验:鸡、油茶、含笑、鸭儿芹等。
技术路线
分析内容
标准信息分析
测序数据质量评估;
与参考基因组比对;
SNP、CNV检测及注释SNP检测及注释;
高级信息分析
构建系统进化树;
全基因组变异图谱绘制;
群体主成分分析;
连锁不平衡分析;
block分析;
选择性清除分析;
基因功能注释。
样品要求
1.样品类型:基因组DNA;
2.样品需求量:单次2 ug;
3.样品浓度:文库≥30 ng/µl;
4.样品纯度:OD260/280为1.8-2.0;
5.电泳要求:主带清晰,无降解或轻度降解。(距送样日最近的电泳结果)